Tyrimo klausimo nustatymas yra metodologinis mokslinio tyrimo atspirties taškas tiek gamtos, tiek socialiniuose moksluose. Tyrimas atsakys į iškeltą klausimą. Bakalauro studijose atsakymas į tyrimo klausimą yra tezė. Atsakymas į tyrimo klausimą padės spręsti "tyrimo problemą", kuri yra problema, "skaitytojų nuomone, verta sprendimo".